Investigador/a Postdoctoral en el proyecto cardiotrAIning para la implementación de un sistema de virtual screening

Status: 
Evaluación
Deadline for submitting applications: 
Monday, 16 September, 2024

El Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III (F.S.P.) (CNIC) ha sido concebido para desarrollar una investigación de excelencia, competitiva y de relevancia internacional en relación con las enfermedades cardiovasculares. El CNIC cuenta con un centro de investigación de 24.000 m2, ubicado en Madrid, con más de 6.000 m2 para laboratorios dotado de una infraestructura y un equipamiento de última generación.

Funciones:

Desarrollar un sistema de virtual screening para medicamentos relacionados con las enfermedades cardiovasculares aplicando técnicas de IA

El programa de formación en IA y Big Data para la Salud Cardiovascular (cardiotrAIning) incluirá cursos teóricos y prácticos impartidos por destacados investigadores en la materia, estancias en instituciones colaboradoras nacionales e internacionales y el trabajo en una línea de investigación relacionada con el uso de la IA para mejorar el diagnóstico, tratamiento y prevención de las enfermedades CV. Para este puesto la línea de investigación será el desarrollo y despliegue de métodos de cribado virtual mediante técnicas de IA.

Más información sobre el programa de cardiotrAIning en los siguientes enlaces:

Convocatoria CardiotrAIning

Anexo I Plan de Formación

Anexo II Líneas de Investigación

Esta beca/contrato está financiada/o por los fondos europeos NextGenerationEU en el marco del Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia a través de la iniciativa de los programas de atracción y retención de talento.

 

Requerimientos imprescindibles:

  1.  Estar en posesión del título de Doctorado en el momento de formalizar el contrato.
  2.  Estar en posesión de máster en Bioinformática o titulación análoga.

Requerimientos valorables:

  • C1. Experiencia y conocimientos en el análisis de datos ómicos.
  • C2. Experiencia trabajando en un clúster de computación de alto rendimiento.
  • C3. Experiencia y conocimientos en lenguajes de scripting, como R y Python. (
  • C4. Experiencia en modelado de estructura de proteína utilizando herramientas como Rosetta y AlphaFold.
  • C5. Entrevista.

Se ofrece:

  • Incorporación a un Centro de Investigación de relevancia internacional en el ámbito científico.
  • Acceso a una infraestructura con la tecnología más avanzada.
  • Integración en equipos jóvenes en un ambiente de excelencia científica.
  • Incorporación antes del 01/01/2025.
  • Contrato de duración determinada de acuerdo con la Disposición Adicional quinta del Real Decreto-ley 32/2021, de 28 de diciembre, de medidas urgentes para la reforma laboral, la garantía de la estabilidad en el empleo y la transformación del mercado de trabajo para la ejecución de programas de carácter temporal cuya financiación provenga de fondos de la Unión Europea, siempre que la persona candidata seleccionada cumpla los requisitos legales para la formalización del contrato con arreglo a derecho. Duración 48 meses.

Plan de selección:

La RESOLUCIÓN DE LA SECRETARÍA DE ESTADO DE FUNCIÓN PÚBLICA POR LA QUE SE APRUEBAN LOS CRITERIOS DE ACTUACION COMUNES EN LOS PROCESOS SELECTIVOS DE LAS ENTIDADES DEL SECTOR PÚBLICO ESTATAL de 11 de abril de 2022, establece en el punto 6.1 que “Salvo que una normativa específica prevea el sistema selectivo de concurso, el sistema selectivo será el de concurso-oposición”

En el caso de CNIC la normativa específica aprobada por el patronato de la Fundación establece un sistema selectivo de concurso con fase de entrevista.

Se realizará una entrevista personal al menos a las 3 candidaturas que obtengan la mayor puntuación, siempre que alcancen el total de 50 puntos en la suma de los criterios evaluables (C1-C4). Se contratará a la persona candidata con puntuación más alta, siempre que alcance los 65 puntos (C1-C5).

Composición de la Comisión de Selección:

  • Jefa de la unidad de Bioinformática
  • Manager de la Oficina de investigación
  • Manager de la Oficina de investigación
  • Asistente de la Oficina de investigación
  • Miembro de RRHH

 

El CNIC garantiza, en su ámbito de actuación, el principio de igualdad en el acceso al empleo, no pudiendo establecer discriminación alguna, directa o indirecta, basada en motivos de origen, incluido el racial o étnico, sexo, edad, estado civil, religión o convicciones, opinión política, orientación e identidad sexual, expresión de género, características sexuales, afiliación sindical, condición social, lengua dentro del Estado y discapacidad, siempre que los trabajadores se hallasen en condiciones de aptitud para desempeñar el trabajo o empleo de que se trate.

Con la participación en el proceso de selección, la persona participante acepta que sus datos figuren en las resoluciones públicas del proceso de selección. Tales resoluciones (relación provisional de admitidos y excluidos, relación definitiva de admitidos y excluidos y resolución del proceso) se publican en la web del CNIC.

 

Criterios de puntuación:

C1. Experiencia y conocimientos en el análisis de datos ómicos. (La experiencia se valorará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 10%

C2. Experiencia trabajando en un clúster de computación de alto rendimiento. (La experiencia se valorará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 20%

C3. Experiencia y conocimientos en lenguajes de scripting, como R y Python. (La experiencia se valorará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 20%

C4. Experiencia en modelado de estructura de proteína utilizando herramientas como Rosetta y AlphaFold. (La experiencia se valorará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 30%

C5. Entrevista. 20%



Enghish version

The Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III (F.S.P.) CNIC has been conceived to develop research of excellence, competitive and of international relevance in relation to cardiovascular diseases. The CNIC has a research center of 24,000 m2, located in Madrid, with more than 6,000 m2 for laboratories equipped with a state-of-the-art infrastructure and equipment.

Functions:

To develop and deploy AI-based virtual screening methods for cardiovascular disease within the cardiotrAIning program

The training program in AI and Big Data for Cardiovascular Health (cardiotrAIning) will involve theoretical and practical courses by prominent researchers in the field, placements in national and international collaborating institutions and the work in a research line related to the use of AI to improve the diagnosis, treatment and prevention of CV disease. For this position the research line will be the development and deployment of virtual screening methods using AI techniques.

More information on the cardiotrAIning program can be found in the following links:

CardiotrAIning call

Annex I Training Plan

Annex II Research Lines

This grant/contract is funded by the European NextGenerationEU funds in the framework of the Recovery, Transformation and Resilience Plan through the Talent Attraction and Retention Programs initiative. 

 

Mandatory Requirements:

  1. To Hold a PhD degree at the time of formalizing the contract.
  2. To Hold a master's degree in Bioinformatics or similar qualification.

Valuable Requirements:

  • Experience and knowledge in omics data analysis.
  • Experience working in a high-performance computing cluster.
  • Experience and knowledge in scripting languages, such as R and Python.
  • Experience in protein structure modeling using tools such as Rosetta and AlphaFold.
  • Interview.

We offer:

  • Opportunity to work in a leading cardiovascular research institution equipped with state-of-the-art resources and technology.
  • Integration in a young translational research team, in a highly competitive environment
  • Start date: Not later than 01/01/2025
  • "Contrato de duracion determinada” in accordance with “Disposición Adicional quinta del Real Decreto-ley 32/2021, de 28 de diciembre, de medidas urgentes para la reforma laboral, la garantía de la estabilidad en el empleo y la transformación del mercado de trabajo para la ejecución de programas de carácter temporal cuya financiación provenga de fondos de la Unión Europea”, as long as the selected candidate complies with the legal requirements for the formalization of the contract in accordance with the Spanish labor law. Duration 48 months

Recruitment Plan:

The RESOLUTION OF THE SECRETARIAT OF STATE FOR PUBLIC FUNCTION APPROVING THE COMMON ACTION CRITERIA FOR THE RECRUITMENT PROCESSES IN THE STATE PUBLIC SECTOR ENTITIES of April 11, 2022, set forth in point 6.1 that “Unless a specific regulation establishes a merit-bases recruitment system (concurso), the competition (concurso-oposición) must be the recruitment system”

In CNIC, the specific regulations approved by the Foundation's board of trustees establish a merit-base recruitment system (concurso) including a personal interview.

At least the 3 candidates with the highest score, as long as they reach the minimum of 60 points as a sum of criteria (C1‐C4) will be interviewed. The candidate with the highest score will be hired given the total score (C1-C5) is higher than 65 points.

Recruitment Commission:

  • Head of Bioinfomatics Unit
  • Research Office Manager
  • Research Office Manager
  • Reserach Office Assistant
  • HR member

 

The CNIC guarantees, within its field of action, the principle of equal access to employment, and may not establish any direct or indirect discrimination, based on grounds of origin, including racial or ethnic origin, sex, age, marital status, religion or beliefs, political opinion, sexual orientation and identity, gender expression, sexual characteristics, trade union membership, social status, language within the State and disability, provided that workers are fit to perform the work or job in question.

By participating in the selection process, the participant agrees that their data appear in the public resolutions of the selection process. Such resolutions (provisional list of admitted and excluded, definitive list of admitted and excluded and resolution of the process) are published on the CNIC website.

Scoring criteria: 
C1 - Experience and knowledge in omics data analysis (Experience will be assessed on a time/specialty basis). - 10%
C2 - Experience working in a high-performance computing cluster (Experience will be assessed on a time/specialty basis). - 20%
C3 - Experience and knowledge in scripting languages, such as R and Python (Experience will be assessed on a time/specialty basis). - 20%
C4 - Experience in protein structure modeling using tools such as Rosetta and AlphaFold (Experience will be assessed on a time/specialty basis). - 30%
C5 - Interview - 20%

"In the event of absence of any of the evaluators an alternate evaluator of the same area will be appointed"