CITOMETRIA DE FLUJO

Citómetros de flujo analizadores digitales

  • Dos FACSCanto II (BD) que incorporan tres líneas de laser (405nm, 488nm y 633nm) capaces de detectar 10 parámetros (2+6+2) simultáneamente.
  • Un LSRFortessa (BD) equipado con cuatro líneas de laser (405nm, 488nm, 561nm and 633nm) capaz de detectar 18 parámetros (7+4+4+3) simultáneamente.
  • Un SP6800 Sony analizador espectral equipado con tres líneas de laser (405nm, 488nm, and 633nm) capaz de detectar señales entre 400 and 800nm.

Sistemas de separación celular

  • Un separador de flujo digital FACSAria SORP (Becton Dickinson) equipado on 6 líneas de láser (355n, 405nm, 449nm, 488nm, 561nm y 640nm) capaz de analizar 20 parámetros simultáneamente. El sistema está ubicado en una campana de bioseguridad BSL2.
  • El separador de flujo Sy3200 (SonyBiotechnology) que incluye dos módulos de sorting completamente independientes, uno equipado con 4 líneas de láser (405nm, 488nm, 561nm and 640nm) y 16 detectores y otro adicional que incluye 2 líneas de láser (488nm and 640nm) y 8 detectores. El sistema está ubicado en una campana de bioseguridad BSL2.
  • Un separador magnético automatizado (Automacs).

Paquetes de software para análisis de datos de citometría (Modfit, FlowJo, FACSDiva, y FCS Express).

Herramienta de diseño de paneles adaptada a los recursos del CNIC: https://app.fluorofinder.com/cnic

RECURSOS PARA “SCREENING” DE ALTO CONTENIDO (HCS)

Manejo de líquidos

  • Plataforma robótica: Una estación de trabajo para el manejo de líquidos conectada e un incubador de células con capacidad para 110 placas (Freedom EVO, Tecan) y un carrusel de almacenaje de placas con capacidad para 220 placas.
  • Contador de células (Coulter)
  • Dispensador de células (Multidrop, Thermo)
  • SpeedVac
  • Pipeta dispensadora manual de 96 puntas…

Equipo de imagen automatizada de alto rendimiento

  • Un microscopio confocal para la lectura automatizada de placas multipocillo (Opera, Perkin Elmer), equipado con un brazo robótico y carrusel de almacenamiento de 14 placas y lector de código de barras.

Colecciones de siRNA genoma completo

  • ON-TARGETplus™ colección de genoma humano completo. 2 colecciones de 0.1nmol en placas de 384 pocillos. Cada una incluye; 18300 genes, 4 siRNAs diferentes por gen. Un total de 73200 siRNAs distribuidos en 528 placas.
  • siGENOME®colección de genoma de ratón completo. 1 colección de 0.1nmol en placas de 384 pocillos. Cada una incluye; 19040 genes, 4 siRNAs diferentes por gen. Un total de 76160 siRNAs distribuidos en 280 placas.

Análisis de imágen

  • La unidad está equipada con paquetes de software para procesamiento de imágen (Acapella, Definiens, MatLab, Amira) y desarrolla algoritmos para análisis de imagen a medida de las aplicaciones requeridas utilizando dichas plataformas de programación y otras herramientas de código abierto (FIJI, KERAS, Caffe).
  • ESC-Track: una herramienta para segmentación 4D, tracking, linaje y análisis dinámico contextual de ESCs.