Técnico/a Titulado Superior para el desarrollo de aplicaciones de Bioinformática en la Unidad de Proteómica

El Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III (F.S.P.) (CNIC) ha sido concebido para desarrollar una investigación de excelencia, competitiva y de relevancia internacional en relación con las enfermedades cardiovasculares. El CNIC cuenta con un centro de investigación de 24.000 m², ubicado en Madrid, con más de 6.000 m² para laboratorios dotado de una infraestructura y un equipamiento de última generación.

El CNIC busca incorporar un/a Técnico/a Titulado/a Superior en Bioinformática especializado/a en Proteómica, para integrarse en la Unidad de Proteómica y participar en el desarrollo y mantenimiento de programas, algoritmos y aplicaciones computacionales avanzadas para el análisis de datos ómicos, especialmente proteómicos.

Funciones:

La persona seleccionada será responsable del mantenimiento, desarrollo e integración de herramientas computacionales que soporten los flujos de trabajo de proteómica cuantitativa de alto rendimiento en el laboratorio de Proteómica. Entre sus funciones se incluyen:

• Desarrollo y optimización de pipelines bioinformáticos para análisis de datos proteómicos (LC-MS/MS, DIA, DDA, PTMs, etc) y su integración con otros datos ómicos y clínicos.
• Mantenimiento, mejora y control de los pipelines desarrollados por la unidad.
• Mantenimiento y nuevo desarrollo de las interfaces gráficas y web desarrolladas por el grupo.
• Colaboración estrecha con bioinformáticos, especialistas en espectrometría de masas e investigadores para traducir las necesidades científicas en soluciones computacionales.
• Posible implementación de técnicas de aprendizaje automático y deep learning aplicadas a la interpretación de datos proteómicos y multi-ómicos.

Requerimientos imprescindibles:

1. Estar en posesión de la titulación de Doctorado o Máster en Bioinformática, Biología Computacional, Informática o áreas afines.
2. Experiencia laboral mínima de 5 años en centros de investigación biomédica (3 años y 4 meses para personas con discapacidad >66%, 4 años y 2 meses para >33%).

Requerimientos valorables:

• C1. Experiencia en programación (Python, C++, R, Bash scripting y otros lenguajes relevantes), y en desarrollo de herramientas bioinformáticas para datos proteómicos y multi-ómicos, utilizando sistemas de control de versiones (Git)iva
• C2. Experiencia en el uso de motores de búsqueda y herramientas para el análisis de datos proteómicos como Proteome Discoverer, MSFragger/FragPipe, DIA-NN, Spectronaut, etc. y desarrollo de aplicaciones análogas en proteómica.
• C3. Experiencia en el desarrollo de entornos reproducibles (Docker, Singularity) y procesos computacionales escalables (Nextflow, Snakemake)
• C4. Experiencia en programación web (JavaScript, React y otros lenguajes relevantes), en la creación de API basadas en web (servicios web SOAP y REST) y en el desarrollo de aplicaciones de escritorio (como Electron).
• C5. Conocimiento o experiencia de bases de datos relacionales NoSQL (MongoDB).
• C6. Conocimientos o experiencia en administración de sistemas GNU/Linux, infraestructura HPC y sistemas de colas (SGE).
• C7. Contribuciones científico-técnicas: publicaciones en revistas científicas indexadas, premios, dirección de TFG/TFM destacados, becas de excelencia, reconocimientos académicos, participación en proyectos con base proteómica.
• C8. Movilidad e internacionalización: experiencia en centros de prestigio nacionales o internacionales, especialmente en investigación proteómica y proteómica cardiovascular.
• C9. Entrevista.

Acción positiva: se estable un índice corrector de 1,5 por cada año de experiencia en la evaluación del cómputo de años en aquellos criterios donde se evalúe la experiencia, en caso de que la persona acredite una discapacidad superior al 66% y de 1,2 en caso de que la persona acredite una discapacidad superior al 33%

Se ofrece:

• Incorporación a un Centro de Investigación de relevancia internacional en el ámbito científico.
• Acceso a una infraestructura con la tecnología más avanzada.
• Integración en equipos jóvenes en un ambiente de excelencia científica.
• Incorporación inmediata.
• Contrato de duración determinada por sustitución de persona trabajadora, de acuerdo con el Real Decreto-ley 32/2021, de 28 de diciembre, de medidas urgentes para la reforma laboral, la garantía de la estabilidad en el empleo y la transformación del mercado de trabajo, Art. 15.3, siempre que la persona candidata seleccionada cumpla los requisitos legales para la formalización del contrato con arreglo a derecho.

Plan de selección:

La RESOLUCIÓN DE LA SECRETARÍA DE ESTADO DE FUNCIÓN PÚBLICA POR LA QUE SE APRUEBAN LOS CRITERIOS DE ACTUACION COMUNES EN LOS PROCESOS SELECTIVOS DE LAS ENTIDADES DEL SECTOR PÚBLICO ESTATAL de 11 de abril de 2022, establece en el punto 6.1 que “Salvo que una normativa específica prevea el sistema selectivo de concurso, el sistema selectivo será el de concurso-oposición”

En el caso de CNIC la normativa específica aprobada por el patronato de la Fundación establece un sistema selectivo de concurso con fase de entrevista.

Se realizará una entrevista personal al menos a las 3 candidaturas que obtengan la mayor puntuación, siempre que alcancen el total de 65 puntos en la suma de los criterios evaluables (C1-C8).  Se contratará a la persona candidata con puntuación más alta, siempre que alcance los 80 puntos (C1-C9).

Composición de la Comisión de Evaluación:

• Responsable del Grupo de Proteómica Cardiovascular
• Jefe de la Unidad de Proteómica
• Manager de la Oficina de Investigación
• Miembro de RRHH

El CNIC garantiza, en su ámbito de actuación, el principio de igualdad en el acceso al empleo, no pudiendo establecer discriminación alguna, directa o indirecta, basada en motivos de origen, incluido el racial o étnico, sexo, edad, estado civil, religión o convicciones, opinión política, orientación e identidad sexual, expresión de género, características sexuales, afiliación sindical, condición social, lengua dentro del Estado y discapacidad, siempre que los trabajadores se hallasen en condiciones de aptitud para desempeñar el trabajo o empleo de que se trate.

Con la participación en el proceso de selección, la persona participante acepta que sus datos figuren en las resoluciones públicas del proceso de selección. Tales resoluciones (relación provisional de admitidos y excluidos, relación definitiva de admitidos y excluidos y resolución del proceso) se publican en la web del CNIC.

Criterios de puntuación:

C1. Experiencia en programación (Python, C++, R, Bash scripting y otros lenguajes relevantes), y en desarrollo de herramientas bioinformáticas para datos proteómicos y multi-ómicos, utilizando sistemas de control de versiones (Git)iva (se evaluará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 15%

C2. Experiencia en el uso de motores de búsqueda y herramientas para el análisis de datos proteómicos como Proteome Discoverer, MSFragger/FragPipe, DIA-NN, Spectronaut, etc. y desarrollo de aplicaciones análogas en proteómica (se evaluará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 20%

C3. Experiencia en el desarrollo de entornos reproducibles (Docker, Singularity) y procesos computacionales escalables (Nextflow, Snakemake) (se evaluará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 5%

C4. Experiencia en programación web (JavaScript, React y otros lenguajes relevantes), en la creación de API basadas en web (servicios web SOAP y REST) y en el desarrollo de aplicaciones de escritorio (como Electron) (se evaluará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad). 10%

C5. Conocimiento o experiencia de bases de datos relacionales NoSQL (MongoDB) (se evaluará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad y/o a la formación acreditada). 5%

C6. Conocimientos o experiencia en administración de sistemas GNU/Linux, infraestructura HPC y sistemas de colas (SGE) (se evaluará en su conjunto atendiendo a la relación tiempo/especialidad y/o a la formación acreditada). 10%

C7. Contribuciones científico-técnicas: publicaciones en revistas científicas indexadas, premios, dirección de TFG/TFM destacados, becas de excelencia, reconocimientos académicos, participación en proyectos con base proteómica (se evaluará de acuerdo con la información aportada). 10%

C8. Movilidad e internacionalización: experiencia en centros de prestigio nacionales o internacionales, especialmente en investigación proteómica y proteómica cardiovascular (se valorará atendiendo al prestigio de la entidad de recepción de la estancia y a la actividad desarrollada en la misma). 5%

C9. Entrevista. 20%